恒温恒湿试验箱都提供两种水循环的方式，一种是重复利用，另外一种是不重复使用直接作为废水排出。

恒温恒湿试验箱如果选择重复利用则可以延长两次加水的时间或者节约纯净水的使用量，相对来讲成本较低，但是因为水在试验箱中会受到污染，如果重复利用，长时间会导致水箱受到污染而使得水无法满足试验要求。例如水中的有机物增加而污染试验样品，这可能导致试验结果的失效。

对于水循环强烈推荐使用后的水直接作为废水排出，从而保证试验结果不受影响，另外也可以保障设备的正常运行。如果需要进行温湿度循环，此时水的用量较大，一般的水箱只可以满足一至两天的试验需求，如果周末需要继续试验，需要有人值班，从而保证恒温恒湿试验箱持续运行。如果对于水箱的大小有顾虑需要经常补充水的，可以考虑增加一套纯净水装置来提供所需要的水，这样就不需要担心由于缺水而无法继续产生所需要的湿度环境。